Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dgcr6O35347 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Dgcr6O35347 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Dgcr6O35347 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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