Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh2d1bO35324 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sh2d1bO35324 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms