Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Scarb2O35114 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarb2O35114 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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