Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casq1O09165 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casq1O09165 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casq1O09165 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casq1O09165 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casq1O09165 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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