Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sprr3O09116 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr3O09116 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms