Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc191J3QQ27 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc191J3QQ27 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc191J3QQ27 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms