Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim34bJ3QNR8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim34bJ3QNR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim34bJ3QNR8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms