Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm21972J3QN38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms