Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim15G3UY57 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim15G3UY57 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199 ms