Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Speer4cG3UXD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4cG3UXD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Speer4cG3UXD1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms