Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf212F6TQD1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf212F6TQD1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms