Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plekhg1F6S200 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Plekhg1F6S200 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Plekhg1F6S200 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Plekhg1F6S200 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plekhg1F6S200 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plekhg1F6S200 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plekhg1F6S200 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plekhg1F6S200 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Plekhg1F6S200 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms