Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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BC030500E9Q6W0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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BC030500E9Q6W0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC030500E9Q6W0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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BC030500E9Q6W0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC030500E9Q6W0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC030500E9Q6W0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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BC030500E9Q6W0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BC030500E9Q6W0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BC030500E9Q6W0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BC030500E9Q6W0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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BC030500E9Q6W0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms