Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Krtap11-1E9Q2E9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Krtap11-1E9Q2E9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms