Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrp3E9Q1T6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrp3E9Q1T6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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