Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cngb1E1AZ71 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Cngb1E1AZ71 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Cngb1E1AZ71 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms