Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5934D3Z4U6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 875.7 ms