Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsbn1lD3Z0K6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsbn1lD3Z0K6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rsbn1lD3Z0K6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsbn1lD3Z0K6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsbn1lD3Z0K6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms