Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif28pD3YXS5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kif28pD3YXS5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms