Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clip3B9EHT4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clip3B9EHT4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clip3B9EHT4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms