Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rrn3B2RS91 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rrn3B2RS91 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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