Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brpf3B2KF05 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brpf3B2KF05 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms