Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfx1B1AY10 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfx1B1AY10 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfx1B1AY10 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms