Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
1700042G07RikB1AUF7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
1700042G07RikB1AUF7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms