Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik3B1AS29 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms