Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prr29B1ARI9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms