Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttll11A4Q9F4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttll11A4Q9F4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms