Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prr16A3KMN5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prr16A3KMN5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr16A3KMN5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms