Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1jA2BFR3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1jA2BFR3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms