Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhbdl2A2AGA4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl2A2AGA4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms