Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef6A2A8M8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms