Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv2A0A0B4J1G8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv2A0A0B4J1G8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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