Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l1Q9Z125 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l1Q9Z125 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Creb3l1Q9Z125 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Creb3l1Q9Z125 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Creb3l1Q9Z125 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Creb3l1Q9Z125 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Creb3l1Q9Z125 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Creb3l1Q9Z125 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Creb3l1Q9Z125 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l1Q9Z125 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Creb3l1Q9Z125 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Creb3l1Q9Z125 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Creb3l1Q9Z125 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Creb3l1Q9Z125 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Creb3l1Q9Z125 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Creb3l1Q9Z125 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l1Q9Z125 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Creb3l1Q9Z125 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l1Q9Z125 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l1Q9Z125 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l1Q9Z125 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l1Q9Z125 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l1Q9Z125 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Creb3l1Q9Z125 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l1Q9Z125 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Creb3l1Q9Z125 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l1Q9Z125 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l1Q9Z125 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Creb3l1Q9Z125 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Creb3l1Q9Z125 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Creb3l1Q9Z125 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l1Q9Z125 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Creb3l1Q9Z125 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Creb3l1Q9Z125 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms