Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUC3

Ly6h, Lymphocyte antigen 6H, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6hQ9WUC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6hQ9WUC3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6hQ9WUC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6hQ9WUC3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly6hQ9WUC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly6hQ9WUC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly6hQ9WUC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ly6hQ9WUC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly6hQ9WUC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6hQ9WUC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6hQ9WUC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6hQ9WUC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms