Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ5

Ramp1, Receptor activity-modifying protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp1Q9WTJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ramp1Q9WTJ5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ramp1Q9WTJ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ramp1Q9WTJ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ramp1Q9WTJ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ramp1Q9WTJ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ramp1Q9WTJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ramp1Q9WTJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ramp1Q9WTJ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ramp1Q9WTJ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ramp1Q9WTJ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ramp1Q9WTJ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ramp1Q9WTJ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ramp1Q9WTJ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ramp1Q9WTJ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ramp1Q9WTJ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ramp1Q9WTJ5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ramp1Q9WTJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ramp1Q9WTJ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ramp1Q9WTJ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ramp1Q9WTJ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ramp1Q9WTJ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ramp1Q9WTJ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ramp1Q9WTJ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ramp1Q9WTJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ramp1Q9WTJ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ramp1Q9WTJ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ramp1Q9WTJ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ramp1Q9WTJ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ramp1Q9WTJ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ramp1Q9WTJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ramp1Q9WTJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ramp1Q9WTJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ramp1Q9WTJ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ramp1Q9WTJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ramp1Q9WTJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms