Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC1

Pcnx1, Pecanex-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcnx1Q9QYC1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcnx1Q9QYC1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcnx1Q9QYC1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcnx1Q9QYC1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcnx1Q9QYC1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcnx1Q9QYC1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcnx1Q9QYC1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcnx1Q9QYC1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcnx1Q9QYC1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcnx1Q9QYC1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcnx1Q9QYC1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcnx1Q9QYC1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcnx1Q9QYC1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcnx1Q9QYC1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcnx1Q9QYC1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcnx1Q9QYC1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcnx1Q9QYC1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcnx1Q9QYC1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcnx1Q9QYC1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcnx1Q9QYC1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcnx1Q9QYC1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcnx1Q9QYC1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcnx1Q9QYC1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcnx1Q9QYC1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcnx1Q9QYC1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcnx1Q9QYC1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcnx1Q9QYC1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcnx1Q9QYC1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcnx1Q9QYC1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcnx1Q9QYC1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcnx1Q9QYC1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcnx1Q9QYC1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcnx1Q9QYC1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcnx1Q9QYC1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcnx1Q9QYC1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcnx1Q9QYC1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcnx1Q9QYC1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcnx1Q9QYC1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcnx1Q9QYC1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcnx1Q9QYC1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcnx1Q9QYC1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcnx1Q9QYC1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcnx1Q9QYC1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcnx1Q9QYC1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms