Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmub1Q9JMG3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmub1Q9JMG3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmub1Q9JMG3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmub1Q9JMG3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmub1Q9JMG3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmub1Q9JMG3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmub1Q9JMG3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmub1Q9JMG3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmub1Q9JMG3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmub1Q9JMG3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmub1Q9JMG3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmub1Q9JMG3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmub1Q9JMG3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmub1Q9JMG3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmub1Q9JMG3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmub1Q9JMG3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmub1Q9JMG3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmub1Q9JMG3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmub1Q9JMG3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmub1Q9JMG3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmub1Q9JMG3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmub1Q9JMG3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmub1Q9JMG3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmub1Q9JMG3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmub1Q9JMG3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmub1Q9JMG3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmub1Q9JMG3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmub1Q9JMG3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmub1Q9JMG3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmub1Q9JMG3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmub1Q9JMG3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmub1Q9JMG3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmub1Q9JMG3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmub1Q9JMG3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmub1Q9JMG3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmub1Q9JMG3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmub1Q9JMG3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmub1Q9JMG3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmub1Q9JMG3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmub1Q9JMG3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmub1Q9JMG3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmub1Q9JMG3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmub1Q9JMG3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmub1Q9JMG3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmub1Q9JMG3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmub1Q9JMG3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tmub1Q9JMG3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmub1Q9JMG3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmub1Q9JMG3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmub1Q9JMG3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmub1Q9JMG3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmub1Q9JMG3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmub1Q9JMG3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmub1Q9JMG3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmub1Q9JMG3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmub1Q9JMG3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmub1Q9JMG3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmub1Q9JMG3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmub1Q9JMG3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmub1Q9JMG3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmub1Q9JMG3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmub1Q9JMG3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmub1Q9JMG3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmub1Q9JMG3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmub1Q9JMG3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmub1Q9JMG3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmub1Q9JMG3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmub1Q9JMG3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmub1Q9JMG3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmub1Q9JMG3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmub1Q9JMG3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmub1Q9JMG3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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