Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vstm2bQ9JME9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vstm2bQ9JME9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vstm2bQ9JME9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vstm2bQ9JME9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vstm2bQ9JME9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vstm2bQ9JME9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vstm2bQ9JME9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vstm2bQ9JME9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vstm2bQ9JME9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vstm2bQ9JME9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm2bQ9JME9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vstm2bQ9JME9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vstm2bQ9JME9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vstm2bQ9JME9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vstm2bQ9JME9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vstm2bQ9JME9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm2bQ9JME9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm2bQ9JME9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vstm2bQ9JME9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms