Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Cd2apQ9JLQ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Cd2apQ9JLQ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Cd2apQ9JLQ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Cd2apQ9JLQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cd2apQ9JLQ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Cd2apQ9JLQ0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Cd2apQ9JLQ0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Cd2apQ9JLQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Cd2apQ9JLQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Cd2apQ9JLQ0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cd2apQ9JLQ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Cd2apQ9JLQ0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Cd2apQ9JLQ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Cd2apQ9JLQ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Cd2apQ9JLQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cd2apQ9JLQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Cd2apQ9JLQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Cd2apQ9JLQ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Cd2apQ9JLQ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Cd2apQ9JLQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Cd2apQ9JLQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Cd2apQ9JLQ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Cd2apQ9JLQ0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Cd2apQ9JLQ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Cd2apQ9JLQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Cd2apQ9JLQ0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Cd2apQ9JLQ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Cd2apQ9JLQ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cd2apQ9JLQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Cd2apQ9JLQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Cd2apQ9JLQ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Cd2apQ9JLQ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Cd2apQ9JLQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cd2apQ9JLQ0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cd2apQ9JLQ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Cd2apQ9JLQ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Cd2apQ9JLQ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Cd2apQ9JLQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Cd2apQ9JLQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cd2apQ9JLQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Cd2apQ9JLQ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Cd2apQ9JLQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Cd2apQ9JLQ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Cd2apQ9JLQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Cd2apQ9JLQ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Cd2apQ9JLQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Cd2apQ9JLQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,26■■■□□ 2,44
Cd2apQ9JLQ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Cd2apQ9JLQ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Cd2apQ9JLQ0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Cd2apQ9JLQ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Cd2apQ9JLQ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cd2apQ9JLQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Cd2apQ9JLQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Cd2apQ9JLQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Cd2apQ9JLQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,9 ms