Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Col5a3Q9JLI2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col5a3Q9JLI2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Col5a3Q9JLI2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col5a3Q9JLI2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col5a3Q9JLI2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col5a3Q9JLI2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col5a3Q9JLI2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col5a3Q9JLI2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col5a3Q9JLI2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col5a3Q9JLI2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col5a3Q9JLI2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col5a3Q9JLI2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col5a3Q9JLI2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col5a3Q9JLI2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col5a3Q9JLI2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Col5a3Q9JLI2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col5a3Q9JLI2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col5a3Q9JLI2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col5a3Q9JLI2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col5a3Q9JLI2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col5a3Q9JLI2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col5a3Q9JLI2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col5a3Q9JLI2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col5a3Q9JLI2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col5a3Q9JLI2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col5a3Q9JLI2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col5a3Q9JLI2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col5a3Q9JLI2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col5a3Q9JLI2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col5a3Q9JLI2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col5a3Q9JLI2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col5a3Q9JLI2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col5a3Q9JLI2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col5a3Q9JLI2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col5a3Q9JLI2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col5a3Q9JLI2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Col5a3Q9JLI2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col5a3Q9JLI2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col5a3Q9JLI2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col5a3Q9JLI2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col5a3Q9JLI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col5a3Q9JLI2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col5a3Q9JLI2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col5a3Q9JLI2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Col5a3Q9JLI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col5a3Q9JLI2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col5a3Q9JLI2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Col5a3Q9JLI2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Col5a3Q9JLI2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col5a3Q9JLI2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col5a3Q9JLI2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col5a3Q9JLI2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col5a3Q9JLI2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col5a3Q9JLI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col5a3Q9JLI2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col5a3Q9JLI2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
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