Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmx1aQ9JKU8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmx1aQ9JKU8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmx1aQ9JKU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmx1aQ9JKU8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmx1aQ9JKU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmx1aQ9JKU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmx1aQ9JKU8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmx1aQ9JKU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmx1aQ9JKU8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmx1aQ9JKU8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmx1aQ9JKU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmx1aQ9JKU8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmx1aQ9JKU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmx1aQ9JKU8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmx1aQ9JKU8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmx1aQ9JKU8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmx1aQ9JKU8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmx1aQ9JKU8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmx1aQ9JKU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmx1aQ9JKU8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmx1aQ9JKU8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmx1aQ9JKU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmx1aQ9JKU8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmx1aQ9JKU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmx1aQ9JKU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmx1aQ9JKU8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmx1aQ9JKU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmx1aQ9JKU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmx1aQ9JKU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmx1aQ9JKU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmx1aQ9JKU8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmx1aQ9JKU8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmx1aQ9JKU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmx1aQ9JKU8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmx1aQ9JKU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmx1aQ9JKU8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmx1aQ9JKU8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmx1aQ9JKU8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmx1aQ9JKU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmx1aQ9JKU8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmx1aQ9JKU8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmx1aQ9JKU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmx1aQ9JKU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmx1aQ9JKU8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmx1aQ9JKU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmx1aQ9JKU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmx1aQ9JKU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmx1aQ9JKU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms