Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trem1Q9JKE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trem1Q9JKE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trem1Q9JKE2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trem1Q9JKE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trem1Q9JKE2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trem1Q9JKE2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trem1Q9JKE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trem1Q9JKE2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trem1Q9JKE2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trem1Q9JKE2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trem1Q9JKE2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem1Q9JKE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem1Q9JKE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trem1Q9JKE2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trem1Q9JKE2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trem1Q9JKE2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trem1Q9JKE2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trem1Q9JKE2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trem1Q9JKE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trem1Q9JKE2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trem1Q9JKE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trem1Q9JKE2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trem1Q9JKE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trem1Q9JKE2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem1Q9JKE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem1Q9JKE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trem1Q9JKE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trem1Q9JKE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trem1Q9JKE2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms