Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Msgn1Q9JK54 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Msgn1Q9JK54 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Msgn1Q9JK54 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Msgn1Q9JK54 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Msgn1Q9JK54 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Msgn1Q9JK54 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Msgn1Q9JK54 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Msgn1Q9JK54 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Msgn1Q9JK54 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Msgn1Q9JK54 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Msgn1Q9JK54 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Msgn1Q9JK54 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Msgn1Q9JK54 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Msgn1Q9JK54 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Msgn1Q9JK54 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Msgn1Q9JK54 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Msgn1Q9JK54 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Msgn1Q9JK54 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Msgn1Q9JK54 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Msgn1Q9JK54 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Msgn1Q9JK54 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Msgn1Q9JK54 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Msgn1Q9JK54 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Msgn1Q9JK54 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Msgn1Q9JK54 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Msgn1Q9JK54 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Msgn1Q9JK54 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Msgn1Q9JK54 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Msgn1Q9JK54 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Msgn1Q9JK54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Msgn1Q9JK54 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Msgn1Q9JK54 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Msgn1Q9JK54 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Msgn1Q9JK54 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Msgn1Q9JK54 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Msgn1Q9JK54 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Msgn1Q9JK54 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Msgn1Q9JK54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Msgn1Q9JK54 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Msgn1Q9JK54 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Msgn1Q9JK54 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Msgn1Q9JK54 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Msgn1Q9JK54 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Msgn1Q9JK54 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Msgn1Q9JK54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Msgn1Q9JK54 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Msgn1Q9JK54 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Msgn1Q9JK54 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Msgn1Q9JK54 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Msgn1Q9JK54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Msgn1Q9JK54 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Msgn1Q9JK54 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Msgn1Q9JK54 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Msgn1Q9JK54 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Msgn1Q9JK54 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Msgn1Q9JK54 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Msgn1Q9JK54 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Msgn1Q9JK54 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Msgn1Q9JK54 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Msgn1Q9JK54 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Msgn1Q9JK54 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Msgn1Q9JK54 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Msgn1Q9JK54 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Msgn1Q9JK54 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms