Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV0

Cryba4, Beta-crystallin A4, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cryba4Q9JJV0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cryba4Q9JJV0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cryba4Q9JJV0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cryba4Q9JJV0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cryba4Q9JJV0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cryba4Q9JJV0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cryba4Q9JJV0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cryba4Q9JJV0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cryba4Q9JJV0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cryba4Q9JJV0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cryba4Q9JJV0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cryba4Q9JJV0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cryba4Q9JJV0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cryba4Q9JJV0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cryba4Q9JJV0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cryba4Q9JJV0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms