Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cacna1fQ9JIS7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cacna1fQ9JIS7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cacna1fQ9JIS7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cacna1fQ9JIS7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cacna1fQ9JIS7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cacna1fQ9JIS7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cacna1fQ9JIS7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cacna1fQ9JIS7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cacna1fQ9JIS7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cacna1fQ9JIS7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Cacna1fQ9JIS7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cacna1fQ9JIS7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cacna1fQ9JIS7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cacna1fQ9JIS7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cacna1fQ9JIS7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cacna1fQ9JIS7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cacna1fQ9JIS7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cacna1fQ9JIS7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cacna1fQ9JIS7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cacna1fQ9JIS7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cacna1fQ9JIS7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cacna1fQ9JIS7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cacna1fQ9JIS7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cacna1fQ9JIS7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cacna1fQ9JIS7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cacna1fQ9JIS7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cacna1fQ9JIS7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cacna1fQ9JIS7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cacna1fQ9JIS7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cacna1fQ9JIS7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cacna1fQ9JIS7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Cacna1fQ9JIS7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cacna1fQ9JIS7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cacna1fQ9JIS7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cacna1fQ9JIS7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cacna1fQ9JIS7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cacna1fQ9JIS7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cacna1fQ9JIS7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cacna1fQ9JIS7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cacna1fQ9JIS7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cacna1fQ9JIS7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cacna1fQ9JIS7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cacna1fQ9JIS7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cacna1fQ9JIS7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cacna1fQ9JIS7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cacna1fQ9JIS7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cacna1fQ9JIS7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cacna1fQ9JIS7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cacna1fQ9JIS7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cacna1fQ9JIS7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cacna1fQ9JIS7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Cacna1fQ9JIS7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cacna1fQ9JIS7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cacna1fQ9JIS7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cacna1fQ9JIS7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cacna1fQ9JIS7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cacna1fQ9JIS7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cacna1fQ9JIS7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cacna1fQ9JIS7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cacna1fQ9JIS7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cacna1fQ9JIS7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cacna1fQ9JIS7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cacna1fQ9JIS7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cacna1fQ9JIS7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cacna1fQ9JIS7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cacna1fQ9JIS7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms