Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Ercc6l2Q9JIM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Ercc6l2Q9JIM3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC39,96■■■■□ 3,99
Ercc6l2Q9JIM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39,91■■■■□ 3,98
Ercc6l2Q9JIM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39,86■■■■□ 3,97
Ercc6l2Q9JIM3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39,85■■■■□ 3,97
Ercc6l2Q9JIM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
Ercc6l2Q9JIM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC39,81■■■■□ 3,96
Ercc6l2Q9JIM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,8■■■■□ 3,96
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Ercc6l2Q9JIM3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Ercc6l2Q9JIM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39,7■■■■□ 3,95
Ercc6l2Q9JIM3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Ercc6l2Q9JIM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC39,7■■■■□ 3,95
Ercc6l2Q9JIM3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39,7■■■■□ 3,95
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39,63■■■■□ 3,93
Ercc6l2Q9JIM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Ercc6l2Q9JIM3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Ercc6l2Q9JIM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,61■■■■□ 3,93
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Ercc6l2Q9JIM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Ercc6l2Q9JIM3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39,57■■■■□ 3,92
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Ercc6l2Q9JIM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Ercc6l2Q9JIM3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39,47■■■■□ 3,91
Ercc6l2Q9JIM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Ercc6l2Q9JIM3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Ercc6l2Q9JIM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Ercc6l2Q9JIM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Ercc6l2Q9JIM3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Ercc6l2Q9JIM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Ercc6l2Q9JIM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Ercc6l2Q9JIM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39,31■■■■□ 3,88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39,28■■■■□ 3,88
Ercc6l2Q9JIM3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Ercc6l2Q9JIM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Ercc6l2Q9JIM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39,11■■■■□ 3,85
Ercc6l2Q9JIM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39,11■■■■□ 3,85
Ercc6l2Q9JIM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Ercc6l2Q9JIM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Ercc6l2Q9JIM3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Ercc6l2Q9JIM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,84
Ercc6l2Q9JIM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC39,06■■■■□ 3,84
Ercc6l2Q9JIM3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Ercc6l2Q9JIM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38,99■■■■□ 3,83
Ercc6l2Q9JIM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Ercc6l2Q9JIM3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,92■■■■□ 3,82
Ercc6l2Q9JIM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Ercc6l2Q9JIM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Ercc6l2Q9JIM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Ercc6l2Q9JIM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38,84■■■■□ 3,81
Ercc6l2Q9JIM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Ercc6l2Q9JIM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38,81■■■■□ 3,8
Ercc6l2Q9JIM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Ercc6l2Q9JIM3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38,76■■■■□ 3,8
Ercc6l2Q9JIM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38,76■■■■□ 3,8
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38,76■■■■□ 3,8
Ercc6l2Q9JIM3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Ercc6l2Q9JIM3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Ercc6l2Q9JIM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38,69■■■■□ 3,78
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,69■■■■□ 3,78
Ercc6l2Q9JIM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38,66■■■■□ 3,78
Ercc6l2Q9JIM3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Ercc6l2Q9JIM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,78
Ercc6l2Q9JIM3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38,57■■■■□ 3,77
Ercc6l2Q9JIM3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38,54■■■■□ 3,76
Ercc6l2Q9JIM3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38,54■■■■□ 3,76
Ercc6l2Q9JIM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38,54■■■■□ 3,76
Ercc6l2Q9JIM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,49■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38,46■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38,46■■■■□ 3,75
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38,44■■■■□ 3,74
Ercc6l2Q9JIM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38,43■■■■□ 3,74
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Ercc6l2Q9JIM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,73
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38,32■■■■□ 3,72
Ercc6l2Q9JIM3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38,31■■■■□ 3,72
Ercc6l2Q9JIM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38,3■■■■□ 3,72
Ercc6l2Q9JIM3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Ercc6l2Q9JIM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms