Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LrbaQ9ESE1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LrbaQ9ESE1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LrbaQ9ESE1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LrbaQ9ESE1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LrbaQ9ESE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LrbaQ9ESE1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LrbaQ9ESE1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LrbaQ9ESE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LrbaQ9ESE1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LrbaQ9ESE1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LrbaQ9ESE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LrbaQ9ESE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LrbaQ9ESE1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LrbaQ9ESE1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LrbaQ9ESE1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LrbaQ9ESE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LrbaQ9ESE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LrbaQ9ESE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LrbaQ9ESE1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LrbaQ9ESE1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LrbaQ9ESE1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LrbaQ9ESE1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LrbaQ9ESE1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LrbaQ9ESE1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LrbaQ9ESE1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LrbaQ9ESE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LrbaQ9ESE1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LrbaQ9ESE1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LrbaQ9ESE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LrbaQ9ESE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LrbaQ9ESE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LrbaQ9ESE1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LrbaQ9ESE1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LrbaQ9ESE1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LrbaQ9ESE1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LrbaQ9ESE1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LrbaQ9ESE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LrbaQ9ESE1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LrbaQ9ESE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LrbaQ9ESE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LrbaQ9ESE1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LrbaQ9ESE1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LrbaQ9ESE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LrbaQ9ESE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LrbaQ9ESE1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LrbaQ9ESE1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LrbaQ9ESE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LrbaQ9ESE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LrbaQ9ESE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LrbaQ9ESE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LrbaQ9ESE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
LrbaQ9ESE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LrbaQ9ESE1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LrbaQ9ESE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LrbaQ9ESE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LrbaQ9ESE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LrbaQ9ESE1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LrbaQ9ESE1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms