Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufa13Q9ERS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufa13Q9ERS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufa13Q9ERS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufa13Q9ERS2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufa13Q9ERS2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ndufa13Q9ERS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufa13Q9ERS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufa13Q9ERS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufa13Q9ERS2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufa13Q9ERS2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufa13Q9ERS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufa13Q9ERS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufa13Q9ERS2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufa13Q9ERS2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufa13Q9ERS2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufa13Q9ERS2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufa13Q9ERS2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa13Q9ERS2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufa13Q9ERS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndufa13Q9ERS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufa13Q9ERS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndufa13Q9ERS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndufa13Q9ERS2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ndufa13Q9ERS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufa13Q9ERS2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndufa13Q9ERS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndufa13Q9ERS2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa13Q9ERS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa13Q9ERS2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndufa13Q9ERS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndufa13Q9ERS2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufa13Q9ERS2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufa13Q9ERS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms