Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Yipf5Q9EQQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Yipf5Q9EQQ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Yipf5Q9EQQ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Yipf5Q9EQQ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Yipf5Q9EQQ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yipf5Q9EQQ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yipf5Q9EQQ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yipf5Q9EQQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Yipf5Q9EQQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Yipf5Q9EQQ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Yipf5Q9EQQ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Yipf5Q9EQQ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Yipf5Q9EQQ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Yipf5Q9EQQ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Yipf5Q9EQQ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Yipf5Q9EQQ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Yipf5Q9EQQ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Yipf5Q9EQQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yipf5Q9EQQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yipf5Q9EQQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf5Q9EQQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf5Q9EQQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf5Q9EQQ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Yipf5Q9EQQ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yipf5Q9EQQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Yipf5Q9EQQ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf5Q9EQQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yipf5Q9EQQ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yipf5Q9EQQ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Yipf5Q9EQQ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Yipf5Q9EQQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms