Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpl4Q9D8E6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpl4Q9D8E6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpl4Q9D8E6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpl4Q9D8E6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpl4Q9D8E6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpl4Q9D8E6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpl4Q9D8E6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpl4Q9D8E6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpl4Q9D8E6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpl4Q9D8E6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpl4Q9D8E6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpl4Q9D8E6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpl4Q9D8E6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rpl4Q9D8E6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpl4Q9D8E6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpl4Q9D8E6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpl4Q9D8E6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpl4Q9D8E6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpl4Q9D8E6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpl4Q9D8E6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpl4Q9D8E6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpl4Q9D8E6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpl4Q9D8E6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpl4Q9D8E6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpl4Q9D8E6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl4Q9D8E6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpl4Q9D8E6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpl4Q9D8E6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpl4Q9D8E6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpl4Q9D8E6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpl4Q9D8E6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpl4Q9D8E6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpl4Q9D8E6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpl4Q9D8E6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl4Q9D8E6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpl4Q9D8E6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpl4Q9D8E6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpl4Q9D8E6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpl4Q9D8E6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpl4Q9D8E6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpl4Q9D8E6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpl4Q9D8E6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpl4Q9D8E6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpl4Q9D8E6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpl4Q9D8E6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpl4Q9D8E6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpl4Q9D8E6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpl4Q9D8E6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpl4Q9D8E6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpl4Q9D8E6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpl4Q9D8E6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpl4Q9D8E6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpl4Q9D8E6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpl4Q9D8E6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpl4Q9D8E6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpl4Q9D8E6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpl4Q9D8E6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rpl4Q9D8E6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rpl4Q9D8E6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpl4Q9D8E6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpl4Q9D8E6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpl4Q9D8E6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rpl4Q9D8E6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpl4Q9D8E6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpl4Q9D8E6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpl4Q9D8E6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpl4Q9D8E6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpl4Q9D8E6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms